靶点筛选

CRISPR/Cas9系统是当今基因编辑领域最热门的明星工具,2013年,Broad研究所的两个研究团队分别在Science杂志同一期上发表了CRISPR文库的相关研究。在此之后,基于CRISPR/Cas9的工具得到了快速发展,CRISPRa,CRISPRi及CRISPR敲除文库已经广泛用于证明新的生物学机制,如耐药性和细胞存活信号。多篇CNS(Cell、Nature、Science)连续报道。利用该技术,研究人员在药物靶标发现、基因功能研究、药物敏感基因研究等领域取得了巨大的成功。

1. HYY现有CRISPR筛选文库
文库类型 文库简介 价格
人源lncRNA 激活库 Human CRISPR lncRNA Activation Pooled Library (SAM-3)

靶向激活10,504个lncRNA
包含96,458个sgRNA靶点

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人源敲除库 Human CRISPR Knockout Pooled Library (GeCKO v2) 

靶向敲除19,050个mRNA 及1864个miRNA
包含123,411个sgRNA靶点

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人源激活库 Human CRISPR Activation Library (SAM-2)

靶向激活23,430个mRNA
包含70,290个sgRNA靶点

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小鼠敲除库 Mouse CRISPR Knockout Pooled Library (GeCKO v2)

靶向敲除20,611个mRNA 及1175个miRNA
包含130,209个sgRNA靶点

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小鼠激活库 Mouse CRISPRa sgRNA library Caprano (P65-HSF)

靶向激活22,774 (Set A), 22,658 (Set B) 个mRNA
包含134,076个sgRNA靶点

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其他 个性化定制 CRISPR/cas9 慢病毒文库

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2.药物靶标发现案例

Molecular Cancer(If 7.776)杂志8月份在线发表了广州市第一人民医院的文章,伊马替尼(格列卫)是一种治疗白血病及胃肠道间质肿瘤的药物,但往往产生耐药,机制不明。在该研究中,研究人员运用CRISPR/Cas9全基因敲除文库在胃间质瘤中筛选并验证了9个可能参与伊马替尼耐药的基因,可以用于深入探讨伊马替尼耐药的分子机制。

筛选”耐药基因的思路
耐药基因筛选、差异基因的通路富集分析
耐药基因功能验证
Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in gastrointestinal stromal tumor  with Imatinib resistance. Molecular Cancer. 2018; 17(1):121-127.
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