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染色质免疫沉淀技术（Chromatin immunoprecipitation assay, ChIP）：是一种研究体内转录因子与基因组DNA之间互作结合的方法。
RIP（RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay，RNA结合蛋白免疫沉淀）实验技术是一种研究细胞内RNA与蛋白的结合互作实验技术，在表观上研究的是转录后的调控技术。
RNA pull down 是一种研究RNA与蛋白结合互作的实验技术方法，生物体内许多功能的核心是RNA与蛋白的结合来进行调控
Co-IP（Co-Immunoprecipitation）基于抗体和抗原之间结合的专一性用于研究蛋白质相互作用的经典方法，是研究两种蛋白在细胞内的相互作用方法。
EMSA凝胶阻滞或电泳迁移率实验（Electrophoretic mobility shift assay）：一种在体外研究DNA或RNA序列与蛋白结合的实验方法，可做精准的结合motif验证与检测。
